Исследователи Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека (Иркутск) и Казанского федерального университета впервые провели сравнительный анализ геномов штаммов вируса клещевого энцефалита европейского субтипа (ВКЭ-Евр), выделенных у больных людей в Восточной Сибири и Европе. В результате исследования, имеющего важное значение для понимания природы вируса и его географического распространения, доказано генетическое сходство штаммов и выявлены потенциальные детерминанты вирулентности изолятов. Научная работа опубликована в журнале Acta Biomedica Scientifica.
Расширение ареала, увеличение уровня заболеваемости, рост числа европейских стран, в которых регистрируются случаи клещевого энцефалита, а также появившаяся информация о летальных случаях заболевания, ассоциированных с европейским субтипом вируса (ВКЭ-Евр), привлекает все больше внимание ученых к этому варианту вируса.
«Для нас был интересны вопросы, насколько штаммы, изолированные в далеких друг от друга точках ареала (Европа и Восточная Сибирь) отличаются друг от друга и какие потенциальные детерминанты вирулентности присутствуют в их геномах. Полученные нами результаты подтверждают генетическую близость сибирских и европейских изолятов ВКЭ-ЕС, что имеет важное значение для лучшего понимания молекулярных основ патогенности вируса, эволюции вируса и его распространения на территории Евразии», — комментирует ведущий автор исследования, руководитель лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики НЦ ПЗСРЧ доктор медицинских наук Ирина Валерьевна Козлова.
Европейский подтип вируса клещевого энцефалита (ВКЭ-Евр) является одним из трех основных подтипов наряду с сибирским (ВКЭ-Сиб) и дальневосточным (ВКЭ-ДВ). ВКЭ-Евр доминирует в Европе, тогда как ВКЭ-Сиб и ВКЭ-ДВ чаще встречаются в Азии. Однако существуют территории, где одновременно встречаются два или даже три основных субтипа вируса, а также два предполагаемых субтипа ВКЭ — Байкальский (ВКЭ-Байк) и Гималайский (ВКЭ-Гим). Одной из таких территорий является Восточная Сибирь, где обнаружены все известные на сегодняшний день субтипы ВКЭ, за исключением гималайского.
В своем исследовании ученые проанализировали все имеющиеся полногеномные последовательности штаммов ВКЭ-Евр, выделенные от больных людей и депонированные в международной базе данных GenBank на момент начала исследований в 2021 году. В работу были включены штаммы, изолированные на территории бывшего СССР, Чешской Республики, Словении и Финляндии в период с 1953 по 2015 годы.
Специалисты доказали, что уровень различий штаммов ВКЭ-Евр из разных географических регионов не превышает установленный ранее максимальный показатель в 3,1 % для данного субтипа.
От Иркутской области в исследовании было представлено три штамма ВЕЭ-Евр, в том числе штамм 1G-98 из коллекции НЦ ПЗСРЧ. В ходе исследований ученые обнаружили, что этот штамм обладает высокими показателями церебральной и периферической активности для лабораторных животных. У него выявлена мутация, которая потенциально может быть ассоциирована с вирулентностью. Кроме того, в геноме обнаружена протяженная делеция в вариабельной части 3'-некодирующей области, сопоставимая по длине с высоковирулентным Hypr из Европы.
Клещевой энцефалит по-прежнему остается одной из наиболее значимых природно-очаговых вирусных инфекций, передающихся через укусы иксодовых клещей. Нозоареал заболевания охватывает не только большую часть территории России, но и 29 стран Европы, а также ряд азиатских государств. Полученные результаты открывают новые перспективы в изучении патогенеза клещевого энцефалита и могут быть использованы при разработке более эффективных методов диагностики и профилактики заболевания.
Исследование проведено лабораторией молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека (Иркутск) совместно с научно-исследовательской лабораторией «Молекулярная вирусология» Института фундаментальной медицины и биологии Казанского (Приволжского) федерального университета.
Пресс-служба НЦ ПЗСРЧ
