Завершила работу школа молодых ученых «Геномика бактерий». Впервые в России студенты и аспиранты реализовали собственные научные проекты, используя секвенатор отечественного производства. Организатором мероприятия выступил Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.
Участие в школе приняли молодые исследователи из Москвы, Санкт-Петербурга, Нижнего Новгорода, Омска и Новосибирска. Каждый из них привез свой объект исследования — микроорганизм, свойства которого еще не изучены. Для оценки свойств бактерий участники провели секвенирование их геномов. Полученные данные позволяют определить характеристики микроорганизма и особенности их взаимодействия с окружающей средой. Информация такого типа может быть востребована в медицине, промышленности и экологии.
Под руководством сотрудников Центра коллективного пользования «Геномика» ИХБФМ СО РАН участники подготовили ДНК-библиотеки — совокупности фрагментов геномов исследуемых бактерий. Использование отечественного набора реагентов «SyntEra» позволило сократить время подготовки образцов до двух часов. Готовые библиотеки были загружены в российский секвенатор «Нанофор СПС». Также в работе использовался секвенатор китайского производства. В результате участники собрали полные бактериальные геномы и провели их таксономическую идентификацию.
Программа школы включала не только практическую работу по геномному секвенированию, но и биоинформатический анализ данных. «Уникальность мероприятия в том, что впервые в рамках школы молодые ученые смогли пройти весь путь — от ДНК до анализа полного генома — с использованием двух платформ высокопроизводительного секвенирования, одна из которых отечественного производства», — отметил руководитель ЦКП «Геномика» кандидат биологических наук ИХБФМ СО РАН Марсель Расимович Кабилов.
Школа молодых ученых «Геномика бактерий» прошла в Новосибирске в рамках IV Всероссийской конференции «Высокопроизводительное секвенирование в геномике».
Пресс-служба ИХБФМ СО РАН
